در ۲۵ مردادماه ۱۳۵۹ اعلامیهی دادستانی انقلاب درباره اعدام یوسف خوشکیش در روزنامهها منتشر میشود. بر اساس آن اعلامیه او در دو روز محاکمه و اعدام شده است. آن اعلامیه می گوید که دادگاه خوشکیش در روزهای ۱۸ تا ۲۰ مردادماه برگزار شده است و او به اتهام مفسد فیالارض و محارب با خدا و رسول مجرم شناخته میشود و در صبح جمعه ۲۴ مردادماه ۱۳۵۹ اعدام میشود. در این اعلامیه آمده است که یوسف خوشکیش در طول مدیریت خود، به اقتصاد کشور خیانت بزرگ کرده بود و مرتکب هلاک حرث و نسل شده بود.